Balkenende ligt opnieuw dwars in de kwestie Fred Spijker. Fred Spijker was een maatschappelijkwerker van defensie. In 1984 moest hij in die functie een weduwe vertellen dat haar man door eigen falen omgekomen was door een landmijn. Spijker vertelde de weduwe naar waarheid dat de mijnen ondeugdelijk waren en dat was het begin van de slepende affaire Spijker, die door defensie als "politiek-crimineel, paranoïde en schizofreen" aan de kant werd gezet.
De affaire heeft een soort clusterbom-effect: Steeds komen er vervolgschandalen aan de orde. Dat de AP-23 mijnen gevaarlijk zijn bleek bij Defensie bekend sinds 1970. Zo is er tientallen keren over gelogen in de kamer. Spijkers werd door twee militairen beschoten. De Schadevergoeding die Spijker kreeg, is voor meer dan de helft weer teruggevorderd via een belastingaanslag. De gemeente Culemborg heeft Balkenende tot twee keer toe verzocht om verantwoordelijkheid te nemen voor Spijkers eerherstel, maar die reageert "formalistisch".
Pr. Mr. Van Vollenhoven is in de zaak gaan bemiddelen. Er wordt over Van Vollenhoven gezegd dat hij op Raad voor de Verkeersveiligheid was gezet omdat werd gedacht dat hij daar weinig kwaad kon, maar Van Vollenhoven heeft een sterk rechtvaardigheidsgevoel en bleek heel goed op zijn plek. Balkenende heeft last van Van Vollenhoven. Welingelichte bronnen hebben de NOS verteld dat hij onder druk van Balkenende opgestapt is als onderhandelaar. De beerput is kennelijk nog groter dan we nu weten, en Balkenende heeft er blijkbaar groot belang bij dat de deksel er op blijft.